依據世界動物衛生組織（World Organisation for Animal Health， WOAH）的規定，狂牛病主要由臨床症狀並配合組織病理檢查以診斷。若懷疑牛隻罹患狂牛病應採取腦底及腦幹等部位的腦組織送至試驗室檢驗，其病原可以接種小白鼠作確診，但因其潛伏期很長，故至少需 292 天的觀察期才能判定。另可透過電子顯微鏡檢查、免疫轉漬（Immunoblotting）或免疫組織化學染色（Immunohistochemical stain）等方法輔助檢出有否病原體存在。